Фамилия Янычек — редкий пример того, как славянская модель фамилии накладывается на имя, которое пришло из другой языковой среды. В основе лежит чешское или словацкое имя Ян — аналог русского Иван. Но суффикс -ек превращает это имя в уменьшительно-ласкательную форму: Янычек буквально означает «маленький Ян» или «Янек». Такие образования с суффиксом -ек характерны для западнославянской ономастики, особенно для чешского и словацкого ареала.

Однако носители фамилии Янычек встречаются и в русскоязычной среде. Чаще всего это потомки переселенцев из Австро-Венгрии или Польши, которые осели в западных губерниях Российской империи в XIX — начале XX века. В русском языке фамилия сохранила исходное написание и произношение, хотя по правилам русской грамматики её следовало бы склонять как существительное мужского рода (Янычек — Янычека). Но в бытовой речи часто склоняют по образцу украинских фамилий на -ко, оставляя форму неизменной в косвенных падежах.

Словообразовательно фамилия стоит особняком: в ней нет типичных русских суффиксов -ов/-ев или -ин, которые указывали бы на принадлежность отцу. Модель с уменьшительным суффиксом -ек говорит о том, что прозвище Янычек закрепилось за человеком как личное, а не родовое. Возможно, первый носитель был младшим в семье или просто отличался небольшим ростом — в чешской традиции такие прозвища давали по внешности или возрасту.

Сравнение с однокоренными фамилиями показывает, что Янычек — более редкая форма, чем Янек или Яник. В Чехии и Словакии она встречается преимущественно в Моравии и восточных районах. В России фамилия остаётся малочисленной и сосредоточена в основном в Калининградской области, Приморье и крупных городах — там, где в XX веке оседали переселенцы из Центральной Европы.

Никаких документальных подтверждений дворянского происхождения или принадлежности к конкретному сословию у фамилии нет. Скорее всего, предки были крестьянами или ремесленниками, а фамилия просто закрепилась как уличное прозвище, которое потом перешло в официальные документы.