Фамилия Янюкина — женская форма фамилии Янюкин, которая образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы через суффикс -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Янюкин — сын Янюки. Сама основа — Янюка — это, скорее всего, уменьшительно-ласкательная форма от крестильного имени Иоанн (в бытовом произношении — Иван). В русских говорах имя Иван дробилось на множество производных: Ваня, Ванюха, Ванюша, а также Яня, Янюка. Чередование начальных И- и Я- в диалектах не редкость: Иван превращался в Яна, а от него — Янюка.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с тюркскими корнями. В некоторых тюркских языках «ян» означает «душа», а «юка» могло быть прозвищем. Но для фамилии, бытующей в русской среде, такое объяснение натянуто: суффикс -ин — славянский, и он крепко привязан к русской антропонимической традиции. Если бы фамилия была тюркской по происхождению, она скорее получила бы окончание -ов или вовсе не имела бы суффикса.

С географической точки зрения фамилия Янюкин (и Янюкина) встречается в основном в центральных и северных регионах России — в Вологодской, Кировской, Костромской областях. Это зона бытования старых русских фамилий на -ин, образованных от имён и прозвищ. В этих краях Иван действительно часто превращался в Яню. Так что предки современных Янюкиных — крестьяне или посадские люди, которых в быту звали Янюкой, а их детей — Янюкиными.

Интересная деталь: фамилия не попала в списки дворянских родов и не фиксируется в старых боярских книгах. Это говорит о её простонародном происхождении. В XIX веке она могла закрепиться за несколькими семьями в разных уездах, не образуя единого гнезда. Поэтому Янюкины — не одна большая родня, а несколько независимых родов, объединённых общим прозвищным корнем.