Фамилия Яштуганова — женская форма фамилии Яштуганов, и её разбор сразу уводит в область тюркской ономастики. Основа «яштуган» вряд ли понятна современному носителю русского языка без словаря, но в ней угадывается тюркский корень, связанный с возрастом или молодостью. Скорее всего, в основе лежит тюркское слово «яш» — «молодой, юный», а «туган» означает «рождённый» или «родственник». В таком случае Яштуган — это прозвище, которое могли дать молодому человеку, юноше, или же имя-пожелание «пусть будет молод (долго жив)». Встречаются и варианты, где «яш» может означать «слеза», но для фамилии значение «молодой рождённый» выглядит правдоподобнее: такие имена часто давали детям, желая им долгой жизни.

Суффикс -ов- типичен для русских фамилий, образованных от тюркских основ: он присоединялся к прозвищу или имени отца, превращая его в фамилию. Модель простая: Яштуган → сын Яштугана → Яштуганов. Географически фамилия тяготеет к регионам, где издавна живут тюркоязычные народы, — Поволжье, Урал, Башкортостан, Татарстан. Носители фамилии, скорее всего, имеют татарские или башкирские корни, хотя в советское время фамилия могла распространиться и за пределы этих областей.

Словообразовательная модель здесь не самая редкая, но сама основа «Яштуган» встречается нечасто. Это не фамилия из списка самых распространённых, что делает её ценной для генеалогии: каждый носитель, скорее всего, может проследить свою линию до конкретного предка с этим прозвищем. Фамилия не несёт указания на сословие — её могли носить и крестьяне, и служилые люди из тюркской среды, принявшие православие или сохранившие мусульманскую веру. В документах XVIII–XIX веков такие фамилии появляются у ясачных крестьян и тептярей, что подтверждает её народное, а не дворянское происхождение.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями вроде Яшегуров или Яштаев, то Яштуганова выделяется именно вторым компонентом «туган», который прямо указывает на родство. В татарской ономастике «туган» часто встречается в именах (Туган, Туганбай), поэтому фамилия может быть и от составного личного имени, а не только от прозвища. В любом случае, для её носителей это прямая отсылка к тюркскому прошлому, где имя или прозвище говорило о человеке больше, чем паспорт.