Основой фамилии Яскунов послужило мирское имя Яскун. Мирское имя Яскун, предположительно, восходит к слову «яска, ясочка», что означает «звезда, звездочка». Слово «яска» является родственным украинскому слову «яскритися», то есть «искриться». Скорее всего, обладатель данного имени родился во время сияния яркой звезды. К подобным именованиям может относиться и имя Яскун. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Яскун, со временем получил фамилию Яскунов.