Фамилия Ятманкина — женская форма мужской фамилии Ятманкин. В основе лежит прозвище или некалендарное имя Ятманка. Модель образования типична для восточнославянского ономастикона: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), то есть Ятманкин — «сын или потомок Ятманки». Формы на -ин характерны для фамилий, образованных от слов, оканчивающихся на -а/-я, и часто встречаются в северных и центральных областях России, а также в Поволжье.

Разбор корня сложнее. Слово «ятман» в русских говорах не фиксируется как распространённое. Наиболее вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках, особенно в татарском, башкирском, чувашском, есть основа «ят» (чужой, посторонний, а также враг) или «ятман» (буквально — «чужой человек», «пришелец», «не свой»). В таком случае Ятманка — прозвище человека, который пришёл со стороны, не из местного рода, или же имя-оберег, данное, чтобы отвести от ребёнка злые силы (как бы «чужой», не свой для нечистой силы). Суффикс -ка в прозвище — уменьшительно-ласкательный или бытовой, характерный для имён и прозвищ в тюрко-русском пограничье (сравните: Сабанка, Байка, Айка).

Менее правдоподобна версия о связи с марийским языком, где есть слово «ят» (ягода) — тогда прозвище могло относиться к сборщику ягод или торговцу ими, но фонетика (переход «ягод» в «ятман») сомнительна. Также не стоит связывать фамилию с русским диалектным «ятовьё» (рыболовная снасть) — здесь нет суффикса -ман.

Географически фамилия Ятманкина (и Ятманкин) встречается преимущественно в регионах с давним тюркским и финно-угорским населением: в Татарстане, Чувашии, Башкортостане, а также в Самарской, Оренбургской, Ульяновской областях. Это указывает на то, что носители фамилии — потомки крещёных татар, чувашей или мишарей, которые получили фамилию по имени предка при переходе в православие в XVIII—XIX веках. Социально это были скорее всего государственные крестьяне или ясачные люди, а не дворяне: фамилии на -ин от тюркских прозвищ редко встречаются в высших сословиях.

Таким образом, Ятманкина — фамилия, которая хранит память о пришлом предке или о древнем имени-обереге, и её корни уходят в тюркскую языковую среду Поволжья.