Фамилия Забебенина образована от прозвища Забебеня, которое, скорее всего, имеет два противоположных толкования. Первое ведёт к глаголу «забубенить» — «разглашать, распускать вести». В этом случае Забебеней называли общительного, словоохотливого человека или глашатая. Вторая версия связывает прозвище с глаголом «бебекать» — «мямлить в говоре, читать по складам». Тогда Забебеня — человек, который говорил невнятно или плохо читал. Оба значения укладываются в логику прозвищ, данных по речевой манере.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: к основе прозвища Забебен- добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Забебенин). Окончание -а в форме женского рода (Забебенина) не меняет смысла: это стандартная запись фамилии для женщины в русской традиции.

Фамилия нечастотная. В Памятной книге Нижегородской губернии за 1914 год упоминается И. Забебенин — это одно из немногих документальных свидетельств бытования фамилии в центральной России. Нижегородский регион традиционно был зоной активного бытования прозвищных фамилий, образованных от глагольных форм, что косвенно подтверждает разговорное происхождение Забебени.

Выбор между «забубенить» и «бебекать» остаётся открытым. Первая версия выглядит правдоподобнее: глагол «забубенить» шире представлен в диалектах, а прозвища по болтливости встречаются чаще, чем по косноязычию. В любом случае фамилия хранит память о речевой характеристике предка — прямом или шутливом указании на то, как он говорил.