Фамилия Зафириди — одна из тех, что сразу указывает на греческие корни. Её основа — мужское имя Зафир, а оно, в свою очередь, происходит от греческого «сапфир» (sappheiros). Так что если переводить фамилию буквально, получится что-то вроде «сын Сапфира» или «потомок того, кого звали Драгоценным камнем».

В античном мире сапфир был не просто красивым минералом. Благодаря своей небесно-голубой окраске его считали священным камнем, посвящённым верховному богу — Зевсу (у римлян — Юпитеру). Небо считалось прибежищем богов, и сапфир, напоминавший о нём, играл роль посредника между смертным и бессмертным. Носить перстни с сапфиром на указательном пальце дозволялось только жрецам: считалось, что так их рука больше походила на небесный свод, заставляя окружающих думать о вечной жизни.

Кроме того, сапфиру приписывали способность помогать понимать язык оракулов. Непосвящённым божественные прорицания казались тёмными, а камень якобы прояснял их смысл. В более широком смысле сапфир воспринимали как застывшую каплю напитка бессмертия — амброзии, которую могли пить только боги. Он стал символом философского созерцания, спокойствия, хладнокровия и надежды. Голубые камни вообще считались мостиком, по которому божественные милости и симпатии переходили к человеку.

Фамилия Зафириди образована по греческой модели с суффиксом -иди, который означает «сын» или «потомок». Это одна из самых распространённых патронимических моделей в Греции (вроде русских -ов/-ев или -ин). Встречаются и варианты написания: Зафириду (женская форма) или Зафиропулос. На русской почве фамилия могла сохранить исходное ударение на последний слог.

Носители фамилии Зафириди — это, скорее всего, потомки греков, переселившихся на территорию Российской империи, в частности в Причерноморье, Крым или на Кубань, где в XIX — начале XX века существовали компактные греческие общины. Встречается фамилия и у понтийских греков.