Фамилия Зафирова образована от мужского имени Зафир, и здесь есть два основных объяснения её корней. Первое и самое вероятное — арабское происхождение: имя Зафир (ظافر) переводится как «победитель», «тот, кто одерживает верх». Второе связывают с греческим словом «сапфир» (sappheiros) — драгоценным камнем синего цвета, и тогда имя могло быть прозвищем по украшению или цвету глаз. В любом случае, суффикс -ов (в женской форме -ова) указывает на типичную для русских фамилий модель: «чей?» — «Зафиров», то есть сын или потомок Зафира.

Фамилия редкая, и её география бытования связана в первую очередь с регионами, где исторически жили тюркские и кавказские народы, а также с русскоязычной средой, куда такие имена проникали через межнациональные контакты. Учитывая арабский корень, имя Зафир распространено у мусульманских народов: татар, башкир, народов Дагестана. В русской среде фамилия могла появиться через крещёных татар или через связи с Востоком.

Однокоренные фамилии — Зафиров, Зафирова — встречаются в Болгарии, Македонии и у южных славян, что подтверждает вторую, греческую версию: через Византию имя попало на Балканы, а оттуда с переселенцами — в Россию. В русских архивах фамилия фиксируется с XIX века, но точное место и время появления конкретного рода Зафировых требует отдельных генеалогических изысканий.

Словообразовательная модель проста: основа — имя Зафир, суффикс -ов (принадлежность), окончание -а (женский род). В мужском варианте — Зафиров. Фамилия не имеет сословной привязки: её могли носить и крестьяне, и горожане, и духовенство. В словарях Б. Унбегауна и В. Никонова эта фамилия не упоминается, что говорит о её редкости и локальном бытовании.