Фамилия Зафировы, как и более распространённая форма Зафиров, восходит к личному имени Зафир. В её основе лежит арабское слово «зафир» — «победитель», «тот, кто одерживает верх». Это имя было хорошо известно в мусульманском мире, а через тюркские народы попало и в восточнославянскую среду.

Время активного проникновения таких имён в русские фамилии — XV–XVII века, когда выходцы из Золотой Орды, а ранее — печенеги и половцы, оседали на русских землях, поступали на службу к московским князьям и получали поместья. Многие из них принимали православие, но сохраняли родовые имена, которые затем закреплялись в фамилиях. Именно поэтому фамилия Зафировы — один из памятников восточной письменности и культуры, вплетённый в историю русского дворянства и служилого сословия.

Существует и вторая, менее вероятная версия: имя Зафир могли связывать с греческим «сапфир» (samfeiros), то есть драгоценный камень. Однако арабская этимология выглядит убедительнее: в тюркской среде имя Зафир встречается чаще, чем гипотетическое греческое заимствование.

Морфологически фамилия образована с помощью стандартного русского патронимического суффикса -ов, который указывает на принадлежность: «сын Зафира». Форма Зафировы (множественное число) говорит о том, что перед нами семейное прозвание целого рода, а не отдельного человека.

Фамилия редкая, и её география почти не изучена. Можно предположить, что её носители встречаются в регионах с исторически сильным тюркским влиянием — в Поволжье, на Урале, в южных областях России. Точных данных о сословной принадлежности нет, но сам факт фиксации фамилии в старых родословных указывает на то, что её первые носители, скорее всего, были людьми служилыми, а не крестьянами.