Фамилия Закержаев — редкая, и её происхождение неочевидно. Скорее всего, она сложилась из двух частей, а не из одного корня. Основа «Закер» или «Закерж» не имеет прямых аналогов в славянских языках, что указывает на заимствование. Наиболее правдоподобная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) «закер» (или «зикер», «зекер») — это форма арабского слова «зикр», означающего поминание, восхваление Бога, религиозный обряд. В таком случае прозвище Закер мог получить человек, известный своей набожностью, или тот, кто руководил коллективным поминанием (зикром). Суффикс «-ж» в середине фамилии — редкий для русского языка, но встречается в тюркских фамилиях, прошедших через русскую канцелярию. Он мог возникнуть как результат адаптации звука «г» или «кь» (например, Закер-г-и → Закерж-аев) или как часть диалектного варианта прозвища (Закержа — форма имени Закер с ласкательным или усилительным суффиксом).

Фамилия образована по русской патронимической модели — с суффиксом «-ев» (после шипящего «ж»). Это значит, что в основе лежит имя или прозвище отца: Закержа → сын Закержи → Закержаев. То есть первый носитель фамилии был сыном человека по прозвищу Закержа. Если отбросить суффикс, то корень «Закер» вполне мог быть личным именем у татар, башкир или народов Кавказа, которое затем русифицировали.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная: фамилия может быть связана с географическим названием. В Закавказье и на Северном Кавказе есть топонимы с корнем «Закер» (например, село Закер в Азербайджане). В таком случае Закержаев — человек, выходец из местности Закер, с добавлением того же суффикса «-ж» для благозвучия. Однако такая модель образования фамилий (от названия села с суффиксом -жаев) встречается реже, чем отчество.

По сословной принадлежности предки Закержаева, скорее всего, были крестьянами или казаками. Фамилия не дворянская и не купеческая — её нет в родословных книгах. Географически фамилия тяготеет к Волго-Уральскому региону (Татарстан, Башкортостан, Оренбуржье), а также к Северному Кавказу, где сильны тюркские и арабо-тюркские ономастические влияния. Встречаемость фамилии крайне низкая, что говорит о локальном происхождении — возможно, от одного родоначальника в конкретном селе или ауле.

Таким образом, Закержаев — это русифицированная тюркская фамилия, в основе которой лежит религиозное прозвище Закер (поминающий Бога) или производное от него имя Закержа. Предки, вероятно, были мусульманами (татарами или башкирами), а сама фамилия закрепилась в русской форме в XIX веке при переписях населения.