Фамилия Закер — редкий пример, где написание разошлось с произношением, а происхождение может быть как немецким, так и еврейским. В обоих случаях корень один — немецкое слово Sacher (тот, кто живёт у болота, или человек, имеющий дело с сырыми, мокрыми местами). Но если фамилия Закер записана через «з» и без «х», это почти наверняка результат адаптации при переселении в Российскую империю: немецкое «Sacher» на слух воспринималось как «Закер», а букву «х» просто опустили.

Вторая версия — от еврейской фамилии Закер, которая восходит к ашкеназскому прозвищу «закер» (помнящий, памятливый) из идиша. В этом случае фамилия указывала на черту характера предка, а не на место жительства. Различить эти два корня на практике почти невозможно без генеалогических документов: обе группы носителей жили на территории бывшей Российской империи, и написание фамилии у них совпало.

Словообразовательная модель проста: фамилия не имеет русского суффикса (-ов, -ин, -ский), что сразу выдаёт её иноязычное происхождение. Это так называемая «чистая основа» — фамилия образована напрямую от прозвища или топонима без дополнительных формантов. В немецкой традиции такие фамилии (Sacher, Zacher) часто давали по названию хутора или местности, например, от Sacher — «житель болотистой низины».

География бытования фамилии Закер в России и странах СНГ — преимущественно южные и центральные регионы: бывшие немецкие колонии Поволжья, Причерноморья, а также еврейские местечки Волыни и Подолья. Встречается она редко, что делает её ценным маркером для поиска предков: если вы носите фамилию Закер, велика вероятность, что ваши предки были либо немецкими колонистами XVIII–XIX веков, либо еврейскими ремесленниками или торговцами из черты оседлости.

Спорный момент — возможная связь с тюркскими языками (например, татарское «закер» — поминающий Бога), но эта версия слабая: в татарской ономастике фамилии такой формы не зафиксированы, а единичные случаи — скорее случайное совпадение. Надёжнее держаться немецко-еврейского следа.