Фамилия Закомалдин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного суффикса -ов или -ин, который сразу указывает на отчество. Формант -дин здесь — это вариант суффикса -ин, возникший из-за того, что основа прозвища оканчивалась на звонкий согласный «д». То есть первоначальная форма была Закомалдин, а не Закомалдин — и это ключ к разгадке.

Основа фамилии — слово «закомалда» или «закомолда». В русских говорах, особенно северных и сибирских, «комолый» значит безрогий, а «комолая» — корова или коза без рогов. Приставка «за-» в таких прозвищах часто имела усилительное или пренебрежительное значение: «закомолда» — человек, которого сравнивали с безрогим животным, либо по внешнему сходству (лысый, с гладкой головой), либо по характеру (смирный, «безрогий», то есть не дающий сдачи). В словаре Владимира Даля «закомолок» — это тупой, бестолковый человек, что подтверждает прозвищную природу.

Есть и вторая, более прозаичная версия. В некоторых диалектах «комол» означало не только безрогость, но и нечто короткое, обрубленное. Тогда «закомалда» могло быть прозвищем невысокого, коренастого человека. В пользу этой гипотезы говорит география фамилии: большинство Закомалдиных встречается в Пермском крае и на Урале, где диалектная лексика особенно богата. Фамилия явно крестьянская, недворянская — такие прозвища давали в сельской среде по внешнему признаку или поведению.

С точки зрения словообразования фамилия ровесница большинства русских фамилий на -ин: она оформилась в XV–XVII веках, когда сына Закомалды стали называть Закомалдиным. Сравните с однокоренными Комолов, Комолкин — они встречаются чаще, но приставка «за-» делает Закомалдина уникальным вариантом, почти не имеющим параллелей в других фамилиях. В современной России носителей мало, и это один из тех случаев, когда фамилия почти не изменила своего первоначального облика за четыреста лет.