Фамилия Закомолдин — одна из тех, где за привычным окончанием скрывается редкая словообразовательная модель. Она образована от прозвища Закомолда с помощью патронимического суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «сын Закомолды». Но интереснее здесь не суффикс, а основа. Она сложена из приставки за- и корня -комол-, который восходит к древнерусскому «комол» или «комолый».

«Комол» — это нижняя, самая толстая часть дерева (комель) или утолщённый конец рога у скота. Отсюда же прилагательное «комолый»: безрогий, гладкий, лишённый острых выступов. Прозвище Закомолда, скорее всего, получил человек дородный, упитанный, «комлем» — так считает большинство лингвистов. Вторая версия относит прозвище к характеру: мягкий, покладистый, «безрогий» человек, с которым трудно поссориться.

Есть и третья, менее вероятная гипотеза — о связи с арабским женским именем Камола (Комола), означающим «совершенство». В этом случае приставка за- и русский суффикс -ин выглядят искусственным наслоением, и объяснить, почему арабское имя получило такую обработку, непросто. Поэтому версия с русским корнем «комол» убедительнее.

Фамилия редкая и, судя по географии, встречается в основном в Поволжье и на Урале — регионах, где в говорах хорошо сохранилась лексика, связанная с крестьянским бытом и скотоводством. Однокоренные фамилии (Комолов, Комолкин) встречаются чаще, а вот форма с приставкой за- — почти уникальна. Именно эта приставка и придаёт фамилии Закомолдин оттенок: не просто «сын Комолы», а «сын того, кто за комолом» или «сын Закомолды» — прозвища, которое уже само по себе было указанием на внешность или нрав.