Фамилия Закрепин — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не ремесло, а, скорее всего, глагол с ярким бытовым значением. Если отбросить суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность («чей?» — сын Закрепы), остаётся корень «закреп-». Самая прямая версия: прозвище Закрепа дали человеку упрямому, настойчивому, «крепкому» в своих решениях. В говорах «закрепа» означала запор, засов, а в переносном смысле — помеху или препятствие. Но скорее всего, прозвище носило положительный оттенок: тот, кто «закрепляет» дело, доводит до конца, надёжный, как засов.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с церковным термином «закрепить» в значении «окрестить», «дать имя». В этом случае Закрепой могли назвать ребёнка, родившегося слабым, с надеждой, что имя «закрепит» его в жизни. Однако в ономастике такая модель встречается реже, чем прозвища по характеру.

Словообразовательная модель Закреп-ин — типичная для северных и центральных русских областей. Суффикс -ин крепится к основам на -а, -я, и если бы прозвище звучало как Закреп, фамилия была бы Закрепов. Форма на -ин намекает, что исходное прозвище было женского рода (Закрепа) или, что чаще, относилось к человеку, которого в быту звали по матери или по прозвищу с окончанием -а. В словаре Веселовского и других ономастических источниках фамилия не зафиксирована как древняя, что говорит о её относительно позднем происхождении — скорее всего, XVIII–XIX век.

Интересно, что однокоренные фамилии — Закрепов, Закрепский — единичны, а Закрепин встречается в основном на юге России и в Поволжье. Это позволяет предположить, что предки носителя фамилии могли быть переселенцами, получившими прозвище за упрямство или хозяйственную хватку. Сословной привязки нет: Закрепины могли быть и крестьянами, и мещанами — прозвище бытовое, без намёка на службу или ремесло.