Фамилия Залкина — женская форма, а мужская, соответственно, Залкин. Её происхождение почти наверняка связано с личным именем или прозвищем Залка. В ономастике это уменьшительная форма от канонического имени Залман (древнееврейское Шломо, то есть Соломон). Такая модель словообразования типична для фамилий еврейского населения Российской империи: к основе, оканчивающейся на гласный, добавлялся суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Залки).

Географически фамилия Залкин (и Залкина) чаще всего встречается на территориях бывшей черты оседлости — в Беларуси, на Украине, в западных областях России. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках её носители фигурируют как мещане или купцы, реже — как ремесленники. Собственно, прозвище Залка могло закрепиться за человеком невысокого роста или с какими-то характерными чертами, но в данном случае религиозный контекст первичен: Залман — одно из самых распространённых еврейских имён, и его производные фамилии (Залкин, Залкинд, Залманов) образуют целое гнездо.

Есть и менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «залка» (заливной луг, пойма) в севернорусских говорах. Однако такая гипотеза разбивается о простой факт: фамилия Залкина почти не встречается в исконно русских регионах, а её концентрация в западных губерниях указывает на еврейские корни. Спор здесь решается географией бытования.

Если говорить о социальном контексте, фамилия Залкина не относится к дворянским или крестьянским — её носители в XIX веке были в основном горожанами, часто связанными с торговлей или мелким предпринимательством. В советское время фамилия потеряла этническую окраску и стала восприниматься как обычная русская фамилия с окончанием -ина.