Фамилия Залужьев — редкий пример, когда географический термин стал основой для прозвища, а затем и фамилии, причём с необычным суффиксальным оформлением. Корень здесь — «залужье», то есть место за лугом, заливной луг или участок земли, расположенный за лугом. В говорах «луг» мог означать не просто травянистое пространство, а пойму реки, низину, где после разлива оставалась влажная трава. «Залужье» — это либо деревня, стоящая за таким лугом, либо надел земли, отрезанный от основного массива. Человек, живший в таком месте или владевший им, получал прозвище Залужье. От него и пошла фамилия.

Особенность Залужьева в том, что суффикс -ев указывает на притяжательную форму: «чей?» — Залужьев, то есть сын или потомок Залужья. Это стандартная модель для фамилий на -ев, но основа здесь не имя и не ремесло, а топографическая характеристика. В ономастике такие фамилии относят к «географическим» — их давали по месту жительства, часто без указания конкретного населённого пункта. Сравните с Заозёровым, Заречьевым или Запольевым — все они образованы по одному принципу, но Залужьев встречается заметно реже.

Вероятнее всего, фамилия сформировалась в северных или центральных областях России, где были распространены названия урочищ и деревень с корнем «залужье». В писцовых книгах XVI–XVII веков упоминаются крестьяне с прозвищем Залужье, но сама фамилия в документах фиксируется с XVIII века, преимущественно в среде государственных крестьян и однодворцев. Дворянских родов с этой фамилией не зафиксировано — скорее всего, предки были земледельцами или бортниками, жившими на отшибе, за лугом, в глухих местах.

Спорных версий происхождения практически нет. Корень слишком прозрачен, чтобы подозревать иноязычное влияние или сложную этимологию. Иногда фамилию путают с Залужским, но суффикс -ск- указывает на принадлежность к целому селу или уезду, тогда как Залужьев — это буквально «сын того, кто живёт за лугом». Более того, в белорусских и украинских говорах «залужжя» означает ещё и «заброшенный, заросший луг», что добавляет оттенок: предок мог получить прозвище за то, что обрабатывал запущенный участок.

Если искать носителей, то фамилия крайне малочисленна. По данным переписей XXI века, Залужьевы встречаются в единичных семьях в Вологодской, Кировской и Костромской областях — как раз в зоне бытования северных говоров с их обилием топонимов на -ье. В других регионах фамилия практически отсутствует, что подтверждает её локальное происхождение.