Фамилия Залужьева — женская форма фамилии Залужьев, и её разбор стоит начать не с корня, а с редкого суффикса. В русских фамилиях продуктивны суффиксы -ов/-ев и -ин, но здесь мы видим -ьев. Этот вариант встречается реже, но указывает на тот же принцип: фамилия образована от прозвища или географического названия, оканчивающегося на мягкий знак (Залужье), либо от притяжательного прилагательного с окончанием -ий (Залужий). Форма Залужьева — это родительный падеж женского рода от Залужьев, что характерно для традиционной модели «чей?»: «дочь (или жена) Залужьева».

Основа фамилии — «залуж-». Она прозрачна для носителя языка: за + луг. В русских говорах «залужье» означало место за лугом, территорию по ту сторону луга, либо, реже, участок заливного луга. Человек мог получить прозвище Залужье, если жил за лугом, владел землей за лугом или был родом из деревни с таким названием. Топонимы Залужье встречаются в разных регионах России, особенно на северо-западе (Псковская, Новгородская, Ленинградская области) и в центральной полосе. Например, деревни с названием Залужье есть в Тверской и Смоленской областях. Это даёт географическую привязку: скорее всего, предки носителей фамилии происходят из этих мест.

Словообразовательная модель с суффиксом -ьев (-ев после мягкого знака) характерна для фамилий, возникших от прозвищ на -ье (Залужье, Подгорье, Заречье). По классификации Б. Унбегауна, это полуотчества или притяжательные прилагательные, которые застыли в форме родительного падежа. В отличие от фамилий на -ов, которые массово давались крестьянам после отмены крепостного права, фамилии на -ьев могли сохранять более архаичную, иногда даже книжную форму, хотя по сословной принадлежности их носители чаще всего были крестьянами или мещанами.

Спорных версий у фамилии немного. Иногда её ошибочно связывают с глаголом «залужить» (замочить, залить), но это значение узко диалектное и не даёт устойчивого прозвища. Версия с «за лугом» — основная и наиболее правдоподобная, она подтверждается и топонимикой, и типичной для русских фамилий моделью «указание на место жительства». Фамилия Залужьева не относится к числу частых, но и не является уникальной: её можно встретить в метрических книгах XIX века по Тверской, Псковской и Ярославской губерниям.