Фамилия Замогильных — один из ярких примеров «географического» суффикса -их/-ых, характерного для северных и сибирских регионов России. Такие фамилии отвечали на вопрос «чьи?» и указывали на принадлежность к определённому роду или дому. В отличие от более распространённых -ов/-ев и -ин, модель на -их/-ых почти не встречается в центральной России и закрепилась в основном в Архангельской, Вологодской, Вятской губерниях и в Сибири, куда переселенцы принесли этот обычай.

Основа фамилии — «замогильный». Скорее всего, прозвище Замогильный дали человеку, жившему за кладбищем, за могилами, на отшибе. В русских деревнях погосты часто располагались за околицей, и дом, стоявший по ту сторону кладбища, называли «замогильным». Такое прозвище мог получить крестьянин, чья усадьба находилась в стороне от основной застройки, у самого погоста. Вторая версия — метафорическая: «замогильным» в народе называли мрачного, угрюмого человека, словно пришедшего с того света. Но первая, топографическая, выглядит правдоподобнее: прозвища по месту жительства давали часто и без особой образности.

Редкий суффикс -ых в этой фамилии не случаен. В говорах Русского Севера фамилии на -их/-ых часто образовывались от прилагательных во множественном числе родительного падежа: Замогильных — «из рода Замогильных». То есть первоначально это было родовое именование всей семьи, а не одного человека. Со временем оно закрепилось как наследственная фамилия.

Встречается фамилия нечасто. По открытым данным, основные очаги — Кировская область (бывшая Вятская губерния) и некоторые районы Сибири, куда вятские крестьяне переселялись в XIX веке. В центральных областях России она практически не фиксируется, что подтверждает её северное происхождение.

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в ряду таких же редких форм, как Задворных, Заозёрных, Запольных. Все они указывают на положение дома или участка относительно какого-то ориентира — в данном случае могил. Никакого мистического подтекста, кроме буквального, в фамилии нет: предки носителя фамилии Замогильных, скорее всего, были обычными крестьянами, чья изба стояла «за могилками», то есть за деревенским кладбищем.