Фамилия Запатрина — женская форма мужской фамилии Запатрин. Её появление связано с прозвищем, которое давали человеку за его отношение к родной земле. В основе лежит глагол «патрить» — в русских говорах он означал «заботиться, опекать, беречь». Прозвище Запатра могли дать крестьянину, который особенно тщательно ухаживал за своим наделом, не бросал землю, держал хозяйство в порядке. Буквально «запатрить» — взять под опеку, «запасти» в смысле сохранить и приумножить.

Словообразовательная модель прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность. Запатрин — «сын Запатры». В русской ономастике такие фамилии чаще всего возникали в северных и центральных губерниях, где прозвища на -а были особенно распространены. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образовывались от полных форм имён, -инные фамилии чаще происходили от прозвищ или уменьшительных имён.

Встречается и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным словом «патра» — так в некоторых областях называли старую, выношенную одежду, тряпку. В этом случае Запатрой могли прозвать неряшливого или бедного человека, ходившего в обносках. Однако такая гипотеза слабее: семантика «заботы» более характерна для прозвищ, которые закреплялись за людьми трудолюбивыми и хозяйственными.

Фамилия редкая, нечастотная. Встречается в основном в Поволжье и на Урале — возможно, её носители были выходцами из старообрядческих общин, где ценили оседлость и бережное отношение к земле. Мужская форма — Запатрин — могла фиксироваться в документах XVII–XVIII веков, но массовых данных о ней нет.