Фамилия Зацеркляный — один из тех случаев, когда написание хранит подсказку о прошлом. Скорее всего, перед нами фонетический вариант более распространённой фамилии Зацерковный (или Зацерквяный). Смысл прозвища прозрачен: человек, живший «за церковью». Такая модель образования фамилий по месту жительства типична для восточнославянской ономастики: сын того, кто жил за болотом, становился Заболотским, за рекой — Зарецким, а за церковью — Зацерковным. В устной речи «церковный» могло звучать как «церквяный», а на письме закрепилось через «ля» — так и появился Зацеркляный.

Менее вероятная, но не исключённая версия связывает основу с белорусским словом «зацірка» — похлёбка из ржаной муки. Если прозвище пошло оттуда, его носитель мог быть поваром, пекарем или мельником. Однако эта гипотеза слабее географической: фамилия встречается в регионах, где церковь была главным ориентиром в сельской местности, а «затирка» — слово узко диалектное.

Сведения о носителях фамилии разбросаны по архивным записям. Например, в документах Москвы упоминается хлебороб Зацерклян Иван Васильевич, родившийся на станции Крымская Кубанской области. Форма «Зацерклян» (без окончания -ый) характерна для южнорусских говоров и украинского влияния, что подтверждает кубанские корни ветви. Фамилия редкая, и каждый документ с ней — маленький ключ к истории конкретной семьи.