Фамилия Зайончковский образована от личного прозвища и относится к распространенному типу славянских фамилий. Фамилия Зайончковский образована от прозвища Зайончик, которое ведет свое начало от белорусского глагола «заенчыць», что в переводе на русский язык означает «замучаться, застонать». Вероятно, таким прозвищем нарекли либо больного человека, либо того, кто постоянно жаловался на жизнь, был чем-то недоволен. По другой гипотезе, прозвище Зайончик восходит к нарицательному «заяц». Давая младенцу такое прозвище, как Зайончик, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного или растительного мира. Согласно еще одной, менее правдоподобной версии, прозвище Зайончик восходит к глаголу «заять» - «прыгать». Исходя из этого, можно предположить, что так могли называть резвого ребенка. О точном месте и времени возникновения фамилии Зайончковский в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Зайончковский представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.