Фамилия Зенун восходит к мужскому имени Зенун, которое, вероятно, является одной из форм греческого имени Зенон. Это старинная форма имени верховного бога греческой мифологии Зевса. В истории христианства известны несколько святых и мучеников, носивших имя Зенон. Поэтому оно было довольно популярно и породило ряд производных форм (Зено, Зенни, Зенос и др.). По другой версии, в основе фамилии лежит другое греческое имя — Зенус. Оно восходит к греческому слову xenos — «иностранец».