Фамилия Ждаркин происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Ждаркин образована от аналогичного прозвища, которое восходит к названию деревни Ждарки района Наход в области Градец-Кралове в Чехии. Сам топоним, вероятно, ведет свое начало от чешского слова zdar, которое в переводе на русский язык означает «успех». Скорее всего, основатель рода Ждаркиных был уроженцем этого села. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Ждаркин, со временем получил фамилию Ждаркин. О точном месте и времени возникновения фамилии Ждаркин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Ждаркин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.