Фамилия Жегунис — один из тех случаев, когда этимология лежит на поверхности, но требует небольшого историко-географического уточнения. Корень здесь — «жегун», то есть «обжигающий», «жгучий». В русских говорах так могли называть человека с горячим, вспыльчивым нравом, либо мастера, работа которого связана с огнём: кузнеца, стеклодува, обжигальщика извести или гончара.

Однако ключевая особенность этой фамилии — суффикс «-ис». Он не характерен для великорусской ономастики, зато типичен для латышских и литовских фамилий. В балтийской традиции суффикс «-ис» (или «-итис») часто указывает на происхождение от отца или на принадлежность к роду, то есть Жегунис буквально означает «сын Жегуна» или «человек из рода Жегунов». Это даёт основание предполагать, что предок носителя фамилии мог быть русским или белорусом, переселившимся на территорию современной Латвии или Литвы, где его прозвище оформили по местной модели. Встречается фамилия и в Латгалии, историческом регионе со смешанным славяно-балтским населением, где адаптация русских корней под латышскую грамматику — обычное дело.

Таким образом, Жегунис — это гибридная фамилия: славянское прозвище, «одетое» в балтийский суффикс. Она не говорит о дворянском происхождении или принадлежности к конкретному сословию, а указывает на ремесленника или человека с крутым нравом, жившего в зоне культурного пограничья. Встречаются варианты написания через «ё» — Жёгунис, что не меняет смысла, а лишь отражает местные особенности произношения.