Фамилия Желомонова — женская форма фамилии Желомонов, и её разговорный вариант с ударением на третий слог (Желомо́нова) может звучать необычно, но корень здесь прозрачнее, чем кажется. Основа «желомон» или «желоман» в русских говорах — не просто прозвище, а указание на конкретную черту или занятие. Скорее всего, перед нами человек, которого в деревне дразнили за привычку жаловаться, ныть или постоянно просить: «жело́мон» — это тот, кто «жело́мит», то есть докучает, канючит, клянчит. Слово это живёт в северных и сибирских говорах, а также встречается в старых псковских записях. Глагол «желомить» родственен «желобить», «желобеть» — идти настойчиво просить, иногда с оттенком навязчивости.

Фамилия образована по стандартной русской модели: прозвище + суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?»). Желомонов — значит «сын (или потомок) Желомона». Суффикс -ин здесь невозможен, потому что основа оканчивается на твёрдый согласный. В документах XVII–XVIII веков прозвище Желомон фиксируется у крестьян и посадских людей Архангельской, Вологодской и Вятской губерний — именно там, где бытовало слово «желомить». Встречается и вариант Желоман (с «а»), но он реже и, возможно, связан с диалектным «желоманный» — капризный, привередливый.

Однокоренных фамилий немного: Желомов, Желомин, Желомцев. Все они образованы от тех же корней, но с разными суффиксами. Желомонова стоит особняком — у неё редкая основа с суффиксом -он, который в русских прозвищах часто придавал оттенок длительности или повторяемости действия (ср. «ворон» от «врать», «кривон» от «кривить»). То есть Желомон — это не просто «жалобщик», а человек, который этим занимался постоянно, навязчиво.

В современных справочниках фамилия встречается редко, преимущественно на северо-западе России и среди потомков переселенцев в Сибирь. Дворянского или купеческого происхождения у неё нет — это однозначно крестьянская или посадская фамилия, возникшая в среде, где прозвища давали по поведению, а не по профессии.