Фамилия Жемулюкина — редкий случай, когда напрашивается связь с литовским языком, но окончательный ответ зависит от того, как фамилия звучала в мужском роде. Если перед нами форма Жемулюкин (а не Жемулюк), то суффикс -ин указывает на происхождение от прозвища или имени, оканчивающегося на -а/-я: Жемуля, Жемулюка. Основа же «жемул-» почти наверняка восходит к литовскому žemulis — «низкорослый», «приземистый» (от žemas — «низкий»). В литовской антропонимии известна фамилия Žemulis, и русское Жемулюкин — это её адаптация с добавлением патронимического суффикса. То есть предок мог получить прозвище Жемуля за невысокий рост или плотное телосложение.

География фамилии тоже подсказывает литовский след. Жемулюкины встречаются в Калининградской области и на юго-западе Псковщины — в зоне исторического соседства с балтийскими народами. В XIX веке литовцы нередко переселялись вглубь России, и их фамилии русифицировались по модели «основа + -ин». Менее вероятная, но допустимая версия — связь с диалектным русским словом «жемуля» (нечто сжатое, сморщенное), однако в говорах оно не зафиксировано, а в литовском аналог есть и даёт чёткую мотивацию.

Обратите внимание на ударение: в большинстве вариантов оно падает на второй слог — Жему́люкина. Если в вашей семье ударение иное (например, на «у»), это может указывать на более позднюю адаптацию или иной диалектный источник. В любом случае, фамилия редкая: в открытых базах данных на всю Россию насчитывается не больше пары десятков её носителей, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска по конкретным регионам.