Основой фамилии Жишкин послужило мирское имя Жишка. Мирское имя Жишка берет начало от аналогичного нарицательного со значением «поросенок». Давая младенцу такое имя, как Жишка, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребенка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделено это животное. Возможно также, что фамилия Жишкин образована от прозвища Жишка, имеющего ту же этимологию, что и имя. Вероятно, именование Жишка относится к профессиональным и указывает на род занятий его обладателя. Так могли назвать того, кто разводил свиней. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Жишка, со временем получил фамилию Жишкин.