Фамилия Жиженин, при всей своей редкости, имеет прозрачную и довольно неожиданную основу. Вопреки возможным ассоциациям с чем-то вертлявым или живым (от глагола «жижать» — пищать, визжать, но это диалектное и редкое значение), корень здесь, скорее всего, связан со словом «жижа». В старых говорах «жижей» называли не только жидкость, но и болотистую, топкую почву, грязь, а также жидкую кашу или похлебку. Прозвище Жижа могли дать либо человеку, который жил у болота или на сырой земле, либо тому, кто постоянно ходил неопрятным, выпачканным, либо — по более безобидной версии — любителю жидкой еды.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность. Жиженин буквально означает «сын Жижи» или «человек из рода Жижи». Суффикс -ин, в отличие от -ов, обычно крепится к основам, оканчивающимся на -а/-я, что и даёт форму Жиженин, а не Жиженов.

В ономастических источниках встречается указание на то, что прозвище Жижа могло быть связано с диалектным словом «жиж» — так в некоторых регионах называли детскую игру или шалуна. Однако эта версия менее распространена, чем «топкая» или «грязная». В словаре древнерусских личных имён есть упоминание крестьянина Жижи (XV век, Новгород), что подтверждает древность прозвища.

Интересно, что фамилия имеет выраженную географическую привязку: основная масса Жижениных исторически проживала в центральных и северных областях России — в Ярославской, Костромской, Вологодской и Архангельской губерниях. Именно там болотистая местность и сырой климат делали прозвище «Жижа» вполне объяснимым. В южных регионах фамилия встречается реже.

Таким образом, предок современных Жижениных — это, скорее всего, крестьянин или ремесленник, получивший прозвище по месту жительства (у болота) или по внешнему виду. Фамилия не дворянская, не служилая, а чисто бытовая, что и делает её типичной для русского крестьянского и посадского населения.