Фамилия Жиженина — женская форма фамилии Жиженин, которая в русской традиции образована по самой распространённой модели: от прозвища или имени, оканчивающегося на -а, -я, с помощью суффикса -ин. Для мужчин это Жиженин, для женщин — Жиженина. В основе лежит слово «жижа» или его производные.

Прямое значение слова «жижа» — густая жидкость, грязь, месиво. В старину это слово могло стать прозвищем человека неопрятного, нечистоплотного, вечно выпачканного в грязи или, например, работающего с жидкими веществами (кожевник, пивовар, красильщик). В говорах «жижа» могла означать и болотистую, топкую местность — тогда прозвище Жиженя мог получить человек, живший у болота или в низком сыром месте.

Менее очевидная, но возможная версия: связь с диалектным глаголом «жижать» — визжать, пищать. В таком случае прозвище Жиженя дали бы человеку с тонким, пронзительным голосом или капризному, плаксивому ребенку. Эта версия менее популярна, но лингвистически правдоподобна: суффикс -еня в русских прозвищах нередко указывал на характерный признак (ср. Визженя, Криченя).

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще носили крестьяне центральных губерний, фамилии на -ин в целом более характерны для северных и северо-восточных территорий России, а также для Поволжья. Фамилия Жиженин встречается нечасто, но её география включает Вологодскую, Кировскую области и Удмуртию — регионы с развитыми болотистыми ландшафтами, что косвенно поддерживает «природную» версию происхождения.

В документах XVII–XVIII веков могли фиксировать варианты Жиженин и Жиженинов, но вторая форма почти исчезла, уступив более краткой. Современный носитель фамилии Жиженина может быть уверен: её корню не меньше трёхсот лет, и он крепко связан с бытовой или природной деталью, которую заметили в предке.