Фамилия Жижикина образована от прозвища Жижика. В основе скорее всего лежит русское слово «жижа» — жидкая грязь. Такое прозвище могли дать человеку, который жил в болотистой низине или на сырой, топкой земле. Модель образования фамилии — суффикс -ин, который в русской традиции указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Жижики». Поэтому фамилия отвечает на вопрос «чьих будете?» и буквально означает «дочь (или жена) Жижики».

Есть и вторая версия, менее распространённая. Украинское слово «жижа» в некоторых говорах означает «огонь». Тогда Жижикой могли прозвать горячего, вспыльчивого человека — и прозвище указывало бы не на место жительства, а на характер предка. Обе гипотезы имеют право на существование, но первая — с «грязью» и болотистой местностью — встречается в русской ономастике чаще: прозвища по природным и ландшафтным особенностям были массовыми, а метафора «жижа = огонь» более локальна и спорна.

Мужская версия фамилии — Жижикин. Встречается она нечасто, что говорит о её относительно позднем закреплении или узком ареале бытования. Если искать родственные фамилии, напрашиваются Жижин, Жижкин, Жижков — все они образованы от тех же корней, но с разными суффиксами. Фамилия Жижикина стоит в этом ряду особняком благодаря редкому суффиксу -ик-, который мог превращать исходное прозвище в уменьшительную или пренебрежительную форму (Жижика — «маленький Жижа»).