Фамилия Жменьковский образована от прозвища или нецерковного имени Жменька. Основа здесь — слово «жменя» (или «жмень»), которое в украинском и южнорусских говорах означает горсть, пригоршню. Прозвище Жменька могли дать человеку маленького роста, щедрому («дающий полной горстью») либо, напротив, прижимистому — смысл зависел от контекста. Слово «жменя» фиксируется в словарях украинского языка с XVI века и было распространено в бытовой речи, поэтому фамилия имеет отчетливую восточнославянскую основу, а не польскую, как может показаться по окончанию.

Суффикс -ский (в исходной форме -овский) указывает на шляхетскую или землевладельческую модель образования фамилий, характерную для Речи Посполитой. Владелец хутора или деревни Жменьково, названной по прозвищу первопоселенца, получал фамилию Жменьковский. Таким образом, предок носителя фамилии, скорее всего, был мелким шляхтичем, однодворцем или казаком, которому пожаловали землю на территории современной Украины или Беларуси. В пользу этого говорит и ареал бытования: фамилия встречается в Черкасской, Киевской, Житомирской областях, реже — в южных регионах России.

Менее вероятная, но допустимая версия — образование напрямую от прозвища Жменька с добавлением суффикса -овский, то есть «сын Жменьки». В этом случае фамилия не привязана к географическому названию, а подчеркивает родство. Однако модель на -ский редко использовалась для прямого патронимического обозначения у крестьян, поэтому версия с владельческим происхождением правдоподобнее.

Однокоренные фамилии — Жменя, Жмень, Жменько, Жменков — встречаются чаще и имеют ту же смысловую основу. Жменьковский же выделяется именно дворянским суффиксом, что сужает круг возможных предков до людей, имевших отношение к земле и службе.