Фамилия Жмукин — одна из тех, чья основа на первый взгляд кажется прозрачной, но при ближайшем рассмотрении открывает несколько равноправных версий. В её центре — глагол «жмукать» или существительное «жмук», которые в разных русских говорах означали разное. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — сын или потомок человека по прозвищу Жмука.

Самая прямая версия отсылает к диалектному слову «жмук» — так в некоторых областях называли скупого, прижимистого человека, который «жмётся» при каждой трате. Прозвище Жмука могли дать расчётливому хозяину или, наоборот, скряге. Однако есть и другая, не менее живая линия: в южнорусских и украинских говорах «жмукать» означало мять, давить, жать. В этом случае прозвище могло относиться к человеку, занятому отжимом чего-либо — например, в сыроварении, при выделке кож или в ткачестве, где требовалось отжимать лён или холсты.

Третья версия выводит фамилию из прозвища, связанного с привычкой щуриться, жмуриться. В некоторых говорах «жмука» — тот, кто постоянно жмурит глаза, возможно, из-за слабого зрения или особенности мимики. Такие прозвища по физической примете — одни из самых устойчивых в русской антропонимии.

Географически фамилия Жмукин встречается не слишком широко, но имеет заметный очаг в Поволжье и на юге России, что подтверждает связь с южнорусской диалектной лексикой. В дореволюционных переписях носители фамилии встречаются среди крестьян и мещан, что типично для фамилий, образованных от прозвищ, а не от церковных имён.

Однокоренные фамилии — Жмурин, Жмуркин, Жмуров — все они вышли из одного гнезда, но разошлись по разным суффиксальным моделям. Жмукин стоит особняком благодаря редкому суффиксу -ин, который в данном случае не от имени на -а (как в фамилиях Сорокин, Фомин), а от прозвища, оканчивающегося на гласный. Такая модель в русских фамилиях встречается реже, чем -ов/-ев, и указывает на более раннее или более местное происхождение.