Фамилия Жубантай — редкий случай, когда русская по форме фамилия сохраняет в основе тюркское имя собственное, почти не изменившееся при заимствовании. Она образована по модели, характерной для народов, входивших в состав Российской империи: к личному имени добавили русский патронимический суффикс -ев. Исходное имя — Жубантай — казахское или башкирское, сложное по составу. Первая часть, «жубан», восходит к древнетюркскому «жубану» — «утешаться», «радоваться», или к варианту имени Жубан (сокращение от Жубаныш — «радость»). Вторая часть, «тай», — распространенный аффикс в тюркских именах, означающий «жеребенок» или выступающий как ласкательно-уменьшительный элемент. Таким образом, Жубантай можно перевести как «радостный жеребенок» или «утешение-малыш» — типичное для кочевых культур имя-пожелание, которое давали ребенку в надежде на легкую и счастливую жизнь.

Словообразовательная модель фамилии — на -ев — указывает на то, что предок носителя фамилии был записан в русских документах как «Жубантай» без отчества, а его дети или внуки получили фамилию по отцу. Это характерно для второй половины XIX — начала XX века, когда у казахов и башкир массово фиксировали фамилии по имени главы семьи. В метрических книгах и переписях того времени имя Жубантай встречается в Западном Казахстане, в Оренбургской губернии и в Башкортостане — регионах, где русские чиновники адаптировали тюркские имена под привычные фамильные суффиксы.

Интересно, что фамилия Жубантай не имеет вариантов с суффиксом -ов, хотя по законам русской грамматики после основ на -й ожидался бы именно он (сравните: Иван — Иванов). Здесь сработала иная логика: в тюркских языках конечный звук «й» воспринимался как часть основы, и при добавлении русского суффикса его не отбрасывали, а присоединяли -ев к полному имени. Такая особенность встречается у фамилий, образованных от имен с конечным -ай, -ей, -тай (например, Ахметай — Ахметаев, Сатай — Сатаев). Жубантай в этом ряду — редкий пример, сохранивший исходную огласовку без переделки в «Жубантаев», хотя в некоторых документах встречается и такое написание.

Сословная принадлежность носителей фамилии, скорее всего, была крестьянской или скотоводческой: предки Жубантай относились к башкирским или казахским родам, которые вели полукочевой образ жизни. Сведений о дворянском происхождении или известных исторических личностях с этой фамилией нет — она бытовала в основном среди простых людей, что типично для поздних тюркских фамилий, оформленных уже в советское время.