Фамилия Зидиров — редкий случай, когда основа почти наверняка указывает на географическое, а не на личное прозвище. Скорее всего, в её основе лежит топоним Зидир — название населённого пункта. Такие «географические» фамилии часто получали выходцы из одного села или города, переехавшие в другую местность: их называли по месту прежнего жительства, а закрепившееся прозвище превращалось в фамилию сыновей.

Где именно мог находиться этот Зидир? Скорее всего, в тюркоязычном регионе — например, в Азербайджане, Дагестане или Средней Азии. Форма Зидир встречается как название аула или урочища. Возможна и связь с тюркским корнем «зид» — «противник», «враждебный», но для прозвища это значение маловероятно: топонимическая версия выглядит убедительнее, так как фамилии на -ов от названий мест — массовое явление.

Модель образования проста: основа Зидир + патронимический суффикс -ов, который в русском языке означает «принадлежащий», «сын такого-то». То есть Зидиров буквально — «сын (выходца из) Зидира». Суффикс -ов указывает, что фамилия оформлялась в русской административной или церковной среде, куда попадали носители нерусских имён и прозвищ. Фамилия недворянская и нестаринная — скорее всего, она возникла не раньше XIX века, когда массово закреплялись фамилии у крестьян и мещан окраин империи.

Других версий, например, от арабского имени Зидир (такого имени нет в классических мусульманских именословах) или от славянского корня, не существует. Это типичная «топонимическая» фамилия, каких тысячи в русском ономастиконе, но с очень узкой географией бытования. Встретить её можно преимущественно на Северном Кавказе и в Закавказье, а также среди потомков переселенцев в центральной России.