Фамилия Зиновейкин образована от имени Зиновейка — уменьшительно-ласкательной формы крестильного имени Зиновий. Само имя Зиновий восходит к древнегреческому «Зенобиос», где первая часть означает «Зевс», а вторая — «биос», то есть «жизнь». В буквальном переводе имя трактуют как «богоугодно живущий». Таким образом, фамилия Зиновейкин — это «сын Зиновейки», то есть потомок человека, которого в быту звали ласково Зиновейкой.

Здесь интересна модель образования: суффикс -кин указывает на принадлежность, причём не к полному имени, а именно к его обиходной, домашней форме. В русской ономастике фамилии на -кин чаще встречаются на севере и северо-западе России, в новгородских и псковских землях, где была сильна традиция называть детей не по святцам, а уменьшительными вариантами. В отличие от распространённых Зиновьевых, которые образованы от полной формы имени, Зиновейкин — вариант более редкий, локальный.

Исходное имя Зиновий в Древней Руси не было особенно частым, но встречалось в среде духовенства и купечества. Однако фамилия Зиновейкин, судя по её «домашнему» суффиксу, скорее сложилась в крестьянской или мещанской среде, где ласкательные имена переходили в фамилии естественным путём, без канцелярского вмешательства.