Фамилия Зиновейкины образована от имени собственного по типичной для русского языка модели. В её основе лежит уменьшительно-ласкательная форма Зиновейка, которая восходит к полному крестильному имени Зиновий. Это имя пришло на Русь с христианством из Византии: в древнегреческом языке оно состояло из двух корней — «Зевс» (верховное божество) и «биос» (жизнь). Полное значение обычно толкуют как «богоугодно живущий», хотя буквальный перевод с учётом античной мифологии даёт «живущий по воле Зевса».

Фамилия закрепляет суффикс -ин, который в русской ономастике указывает на принадлежность: «чей?» — Зиновейкин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Зиновейка. Такая словообразовательная цепочка (Зиновий → Зиновейка → Зиновейкины) встречается нечасто: обычно от имени Зиновий образовывали фамилии Зиновьев или Зиновьевский. Форма с суффиксом -ейк- — редкий вариант, характерный скорее для северных и северо-восточных говоров, где любили «растягивать» имена ласкательными суффиксами.

Точное время и место возникновения фамилии Зиновейкины установить сложно. Процесс закрепления фамилий в крестьянской среде завершился в основном к концу XIX века, но отдельные прозвища могли передаваться по наследству и раньше. Можно предположить, что предки носителей фамилии жили в регионах, где была распространена именно такая уменьшительная форма имени, — вероятно, в бассейне Северной Двины, на Вятке или в Приуралье.

По своему типу фамилия Зиновейкины — типичный «патроним» (фамилия от имени отца), но с нестандартным суффиксальным оформлением. Она не относится к дворянским или княжеским родам, а скорее указывает на крестьянское или мещанское происхождение. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках такая фамилия встречается редко, что делает её ценной для генеалогического поиска: каждый документально подтверждённый носитель — это ниточка к конкретной семье и местности.