Фамилия Зиновеев — один из тех случаев, когда написание подсказывает происхождение точнее, чем можно было бы ожидать. В основе лежит каноническое мужское имя Зиновий (от греческого Зенобиос — «живущий по-божески» или «получивший жизнь от Зевса»). Но почему не Зиновьев, а Зиновеев? Всё дело в старой русской традиции произношения и написания. В разговорной речи XIX — начала XX века имя Зиновий часто произносили как Зинове́й, с ударением на последний слог и отчётливым «е» в середине. От этой формы и образовали фамилию с помощью патронимического суффикса -ев. Так что Зиновеев — это не ошибка и не редкий вариант, а прямая запись того, как имя звучало в быту.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русских фамилий: имя (Зиновей) + суффикс принадлежности (-ев), означающий «сын Зиновея» или, позднее, «потомок Зиновея». В документах фамилия могла записываться и как Зиновьев — от церковнославянской формы имени, и как Зиновеев — от народной. Оба варианта сосуществовали, и выбор зависел от грамотности писаря и местной традиции. Встречается и более редкая форма Зиновеевский, но это уже фамилия, образованная через притяжательное прилагательное с суффиксом -ск-, что характерно для польского или украинского влияния.

Географически фамилия Зиновеев не привязана к одной области, но чаще встречается в центральных губерниях России и в Поволжье. Предки носителей этой фамилии могли быть крестьянами, мещанами или купцами — патронимическая фамилия не указывает на сословие, а лишь на имя родоначальника. В духовном сословии фамилия тоже встречалась, но реже, чем, например, Зиновьевский. Если ваш предок носил фамилию Зиновеев, скорее всего, его звали Зиновий, а окружающие в быту называли его Зиновеем — и это прозвище закрепилось за детьми.

В ономастических трудах, например в словаре Б. Унбегауна, фамилия Зиновеев не выделяется отдельно, а рассматривается в ряду производных от Зиновий. Однако именно вариант с двойным «е» — хороший маркер живой речи, не исправленной церковным книжным произношением. Это делает фамилию не просто родовым именем, а маленьким свидетельством того, как на самом деле говорили люди.