Фамилия Зизенков образована от личного прозвища и относится к распространенному типу славянских фамилий. Фамилия Зизенков является русифицированной украинской фамилией, на что указывает суффикс -енко. Она образована от украинского нарицательного «зиз», что в переводе на русский язык означает «косоглазие». Очевидно, такое прозвище указывало на физические недостатки его обладателя. О точном месте и времени возникновения фамилии Зизенков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Зизенков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.