Фамилия Зусева — женская форма, а её основа — мужская фамилия Зусев. В русской традиции фамилии на -ов/-ев образуются от имён или прозвищ, оканчивающихся на твёрдый или мягкий согласный. Здесь суффикс -ев присоединён к основе «Зус», что сразу указывает на неканоническое, скорее всего, еврейское происхождение корня.

Корень «Зус» восходит к еврейскому личному имени Зус (Zus), которое является сокращением от имени Зусман. Зусман, в свою очередь, — это вариант имени Зелигман или Залман, означающего «блаженный, счастливый» (от идиш «zuser» — сладкий, приятный). В ашкеназской среде такие сокращённые формы были обычны: Зус, Зуся, Зусь. Фамилия Зусев (и Зусева) фиксируется в основном среди еврейского населения бывшей черты оседлости — на территории современной Украины, Беларуси и юга России.

Версия о славянском происхождении маловероятна. В русских говорах нет слова «зус» или «зуся» в значении прозвища; если бы оно и существовало, то скорее образовало бы фамилию Зусин или Зусов, а не Зусев. Форма с мягким знаком в основе (Зусь → Зусев) — типичный признак адаптации еврейских имён в русскую фамильную модель: ср. Гусев от Гусь, но здесь «Зусь» не птица, а имя.

Интересная деталь: фамилия Зусева встречается реже, чем Зусев, и часто в документах XIX века её записывали с колебаниями — Зусев, Зусева, иногда Зусов. Это говорит о том, что носители могли не иметь строгой фиксации фамилии до ревизских сказок. Если ваши предки носили эту фамилию, скорее всего, они были мещанами или ремесленниками из местечек Волынской, Подольской или Киевской губерний.