Фамилия Абабакиров — редкий пример тюркско-арабского сплава, который закрепился на русской почве благодаря суффиксу -ов. Её основа — мужское имя Абабакир, которое встречается у тюркских народов (особенно у кумыков, ногайцев, татар) и восходит к арабскому Абу Бакр (أبو بكر). В переводе с арабского «Абу Бакр» означает «отец девственницы» — это не прозвище, а почётное прозвище-кунья: так называли первого халифа, сподвижника пророка Мухаммеда, отца его любимой жены Аиши.

В тюркской среде имя адаптировали: арабское «Абу» часто стягивалось до «Аба», а «Бакр» переходило в «Бакир». Так возникло имя Абабакир — двусоставное, где первая часть уже не воспринималась отдельно. Суффикс -ов в фамилии — чисто русский, патронимический: он показывает, что Абабакиров — это «сын Абабакира». Такая модель типична для фамилий, возникших в XIX–XX веках у народов Северного Кавказа и Поволжья, когда при переписях или в документах русские чиновники русифицировали местные имена по привычному образцу.

Географически фамилия тяготеет к Дагестану, Чечне и Ставропольскому краю. Встречается и у казахов, но реже: в казахской ономастике предпочтительнее форма Абабакиров с ударением на последний слог, хотя в русском произношении оно обычно падает на третий — Абаба́киров. Интересно, что в самой арабской традиции кунья «Абу Бакр» никогда не становилась фамилией в современном смысле — это именно именная часть. Абабакиров же, напротив, превратилась в наследственную фамилию, потеряв связь с реальным отчеством.

Двойное «а» в начале — результат сращения: если разбить на Аба-Бакиров, видна внутренняя рифма, характерная для тюркских имён-повторов. В русском языке такое удвоение режет глаз, но оно исторически оправдано: сокращать до «Абакиров» или «Бабакиров» значило бы разрушить исходную конструкцию. Фамилия не имеет отношения к кавказскому слову «аба» (отец) в единственном числе — здесь именно составное имя с двумя отсылками к отцовству.