Фамилия Абакачев ведет к тюркскому личному имени Абакач. В тюркских языках, особенно у народов Поволжья и Кавказа, корень «аба» означал «отец», «старший родственник», «дедушка», а также служил уважительным обращением. Суффикс -ч (-кач) придавал имени уменьшительно-ласкательный оттенок, примерно как в русском «папочка» или «батюшка». Так что Абакач — это «маленький отец», ласковое прозвище для младшего родственника или детское обращение.

Русский суффикс -ев указывает на принадлежность: Абакачев значит «сын Абакача» или «из его рода». Такая модель типична для фамилий, образованных от тюркских имен, попавших в русскую среду через крещение или ассимиляцию. Фамилия могла возникнуть среди татар, башкир, чувашей или других народов, где имя оставалось мирским, домашним, а при записи в документы оформлялось по русскому образцу.

Географически Абакачев встречается в регионах традиционного расселения тюркских народов: в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Самарской областях. Есть она и на Северном Кавказе, особенно у кумыков и ногайцев, где имя Абака (Абакай) тоже известно. В метрических книгах XVIII–XIX веков попадаются записи о крестьянах и мещанах с этой фамилией, но массового распространения она не получила — это редкая фамилия, что делает её ценной для генеалогического поиска.

С точки зрения ономастики, Абакачев стоит в одном ряду с фамилиями Абаканов, Абашев, но важно не путать с Абакумовым: тот происходит от христианского имени Аввакум, тогда как Абакачев — чисто тюркская основа. Споров о происхождении почти нет, версия с именем Абакач общепризнана. Встречается вариант написания Абакачёв с буквой ё, но это орфографическая случайность, не меняющая сути.