Фамилия Абакумен — одна из тех, где за привычным звучанием стоит целый пласт истории, и её разбор стоит начать не с имени, а с суффикса. Модель образования здесь нечастая: суффикс -ен, который является украинским вариантом общеславянского -ин. В старину он указывал на принадлежность, родство, то есть Абакумен буквально значило «сын Абакума», «маленький Абакум». Со временем суффикс потерял это прямое значение и закрепился как фамильный признак, но именно он выдаёт украинское происхождение фамилии — в великорусских землях чаще встречаются формы Абакумов или Абакушин.

Имя Абакум, лёгшее в основу, — это народная, обиходная форма канонического имени Аввакум. Восходит оно к древнееврейскому слову, которое переводят как «объятие Божие». В православных святцах днями памяти значатся мученик Аввакум (19 июля) и пророк Аввакум (15 декабря). Однако самое сильное влияние на восприятие этого имени в русской культуре оказал не библейский персонаж, а протопоп Аввакум, лидер старообрядчества XVII века. Его жизнь — это история непримиримой борьбы: он отстаивал старые обряды против реформ патриарха Никона, за что прошёл заточение в Спасо-Андрониковом монастыре, одиннадцатилетнюю сибирскую ссылку и трёхлетнее заключение в Пустозерске. В скитаниях умерли двое его детей, а сам он был сожжён на костре. При этом Аввакум оставил богатое литературное наследие — знаменитое «Житие», «Книгу бесед», «Книгу толкований», и его считают родоначальником новой российской словесности, вольного образного слова и исповедальной прозы.

Связывать напрямую носителей фамилии Абакумен с протопопом было бы натяжкой: фамилия эта бытовая, она могла возникнуть в любой семье, где отца звали Абакумом. Но исторический контекст имени даёт фамилии дополнительный объём, окрашивая её в тона стойкости и убеждённости.