Фамилия Абакутина образована от мужского имени Абакум, которое, в свою очередь, является русской народной формой церковного имени Аввакум. В основе лежит древнееврейское слово, означающее «объятие» или «обнимающий» — в христианской традиции это имя носил один из двенадцати малых пророков. В быту имя Аввакум часто упрощалось до Абакум, а от него уже пошли фамилии.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Абакутин — это «сын Абакума» или, шире, «человек из семьи Абакума». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на твёрдый согласный (Абакум → Абакум-ин). Женская форма Абакутина, строго говоря, изначально означала «жена Абакутина» или «дочь Абакутина», но в современном русском языке она закрепилась как фамилия женщин.

Интересная деталь: имя Аввакум в русской среде всегда было редким, в отличие от, скажем, Ивана или Петра. Поэтому и фамилия Абакутина встречается нечасто. Она имеет очаговый характер — её носители чаще всего сосредоточены в старых русских областях: в Поволжье, на Вятке, в некоторых районах Архангельской и Вологодской губерний. Это объясняется тем, что имя Аввакум почиталось старообрядцами, которые селились компактно, в глухих местах. Знаменитый протопоп Аввакум, лидер старообрядчества XVII века, сделал это имя почти символом раскола, и среди его последователей называть сыновей Аввакумом было делом принципа.

Таким образом, предки Абакутиных, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, жившими в общинах, где имя Аввакум передавалось из поколения в поколение. В официальных документах XIX века фамилия могла писаться через «о» — Абакутинъ, а в просторечии иногда звучала как Обакутин, что отражает акающее произношение центральных и северных говоров.