Фамилия Абакова образована от прозвища Абак, которое восходит к аналогичному нарицательному со значением «счётная доска, применявшаяся для арифметических вычислений в Древней Греции, Риме, затем в Западной Европе до 18 века». Можно предположить, что предок Абаковых был торговцем. Согласно другой версии, в основе фамилии лежит татарское мужское имя Абак, которое в переводе на русский язык означает «старший брат». Возможно, нарекая ребенка таким именем, родители желали, чтобы их сын стал любящим и заботливым братом для своих братьев и сестер. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Абак, со временем получил фамилию Абакова.