Фамилия Абакеева — женская форма фамилии Абакеев, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Абакей. Основа здесь — тюркское имя Абакай, которое в разных диалектах могло означать «старший брат», «дядя» или «отец». В татарской и башкирской среде это имя встречалось как уважительное обращение к старшему родственнику, а иногда и как личное имя. Таким образом, предок носительницы фамилии, скорее всего, был человеком, которого в округе звали Абакеем — либо по имени, либо по прозвищу, подчёркивающему его возраст или статус.

Модель образования типична для русских фамилий, адаптированных из тюркских основ: суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного) присоединялся к основе, чтобы указать на принадлежность — «сын Абакея». Окончание -а в женской форме указывает на то, что речь идёт о женщине из рода Абакеевых. Это не редкий случай: множество русских фамилий тюркского происхождения (например, Абдулов, Аксаков) прошли через такой же путь — от личного имени через отчество к фамилии.

Географически фамилия Абакеева чаще всего встречается в Поволжье и на Урале, особенно в Татарстане, Башкортостане и соседних областях. Это закономерно: именно здесь веками жили смешанные русско-тюркские общины, где происходил активный обмен именами и прозвищами. Встречается она и среди крещёных татар, и среди русских, чьи предки когда-то переняли тюркское имя.

В русских документах XVI–XVII веков имя Абакей фиксируется как вполне обычное: например, в переписях служилых людей и крестьян на южных рубежах государства. Это говорит о том, что носители фамилии могли быть не только татарами, но и русскими, получившими такое прозвище за связь с тюркским миром. Сословная принадлежность предков варьировалась: от крестьян до мелких служилых людей, но без дополнительных генеалогических изысканий точнее сказать сложно.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Абакеева стоит в одном ряду с Абакумовым и Абакиным, но у них разные корни. Абакум — это русская форма библейского имени Аввакум, а Абака — сокращение от того же имени. Абакей же — чисто тюркский корень, и это главное отличие, которое сразу указывает на происхождение фамилии.