Фамилия Абдеева — женская форма фамилии Абдеев. В основе, скорее всего, лежит мусульманское мужское имя Абади. С арабского оно переводится как «вечный» или «неиссякаемый» — эпитет, который мог даваться ребенку как пожелание долгой жизни или как одно из имен Всевышнего. В тюркских языках, особенно у татар и башкир, имя могло звучать как Абди или Абдей, откуда и пошла основа Абде-.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ев, который присоединялся к основам на мягкий согласный или на -й. В данном случае суффикс закрепил отчество: Абдей → сын Абдея → Абдеев. Форма Абдеева, соответственно, означает «принадлежащая роду Абдеевых» или «дочь/жена Абдея». Эта модель типична для фамилий, возникших в среде крещеных татар или в регионах с сильным татарским влиянием — например, в Поволжье, Приуралье или среди касимовских татар.

Корень фамилии встречается и в других вариантах написания — Абдеев, Абдиев, Абдеевский. Редкость фамилии Абдеева (по сравнению с более частыми Абдуллин или Абдрахманов) указывает на локальное бытование: возможно, род происходил из одного села или небольшой группы поселений. Процесс формирования фамилий был длительным, поэтому точное место и время возникновения рода Абдеевых можно установить только по генеалогическим документам — метрическим книгам или ревизским сказкам.