Фамилия Абсеева — нечастая, но её происхождение укладывается в несколько прозрачных моделей, хотя и с оговорками. Сразу обращает на себя внимание окончание -ева: это женская форма от фамилии Абсеев. Но в русской традиции фамилии на -ев/-ов образуются от основ, оканчивающихся на согласный или -й, а здесь основа заканчивается на гласный. Это первый сигнал, что перед нами не исконно великорусская фамилия, а скорее всего — адаптированная, пришедшая из тюркских языков.

Самая вероятная версия ведёт к тюркскому мужскому имени Абсей (вариант Абсалям, Абсеит) — сложносоставному арабскому имени, где первая часть «абд» означает «раб» (в религиозном контексте — «раб Всевышнего»). Вторая часть может восходить к арабскому «салям» (мир) или «сайид» (господин). В тюркской среде такие имена сокращали до Абсей, Апсей, а от них уже образовывали фамилии. Если бы фамилия была русской по происхождению, мы бы ожидали форму Абсеев от прозвища Абсей — но такого прозвища в русских говорах не зафиксировано.

Географически фамилия Абсеева встречается в Поволжье, особенно среди татар и башкир, а также в казахской среде. Встречаются варианты написания — Апсеева, Абсаева, что подтверждает тюркский след: в тюркских языках звонкие и глухие согласные в начале слова часто чередуются. Модель образования проста: к имени Абсей добавили русский патронимический суффикс -ев (по аналогии с тем, как из имени Иван делали Иванов), а затем — окончание женского рода -а. Предки носителей фамилии, скорее всего, были мусульманами, принявшими русскую фамилию при переписях или переходе в православие.

Более редкая, но не исключённая версия — связь с арабским словом «абс» (хмурый, суровый). В этом случае фамилия могла быть прозвищем по характеру. Но эта гипотеза слабее: прозвища такого типа в тюркской среде почти не встречаются, а имя Абсей как личное имя — вполне реальный антропоним, зафиксированный в ономастических справочниках. Так что правдоподобнее считать, что Абсеева — это фамилия, образованная от тюркского варианта арабского имени, и её носители — потомки людей, носивших это имя в качестве личного.