Фамилия Абсеев — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней нет привычного для русских фамилий суффикса принадлежности -ов/-ев, который обычно присоединялся к основе на твёрдый или мягкий согласный. Здесь основа «Абсей» (с ударением, скорее всего, на первый слог) и суффикс -ев. Но что такое «Абсей»?

Самый вероятный путь — тюркское происхождение. В татарском, башкирском, казахском языках есть имя Абсей (варианты: Апсей, Апсай), которое восходит к арабскому «Аббас» (عباس) — «хмурый», «суровый», или к составному имени с компонентом «Абд» (раб) + «Сей» (сокращение от Сейид — господин). В тюркской среде такие имена давали, чтобы защитить ребёнка от сглаза или в честь уважаемого предка. Соответственно, Абсеев — «сын Абсея», «потомок Абсея». Фамилия могла возникнуть у крещёных татар, башкир или других тюркских народов Поволжья и Приуралья, которые после принятия православия получали русские по форме фамилии на -ев.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с арабским словом «абс» (عبس) — «морщить лоб», «быть мрачным». Прозвище Абсей могли дать человеку с суровым выражением лица или угрюмым нравом. Однако в русской традиции такие прямые заимствования из арабского без посредничества тюркских языков встречаются крайне редко, поэтому основная гипотеза — именно тюркская.

Географически фамилия Абсеев тяготеет к регионам с компактным проживанием татар и башкир: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская области. Встречается она нечасто, поэтому носители фамилии, скорее всего, связаны общим предком, который жил не позднее XVII–XVIII века. Сословно это могли быть государственные крестьяне, ясачные люди или служилые татары, которые несли сторожевую службу на южных и восточных рубежах России.

В написании фамилии возможна путаница: иногда её записывали как Абсеев, иногда как Обсеев (под влиянием акающего произношения). Но корень остаётся тем же — личное имя Абсей, которое со временем стало фамилией.