Фамилия Агальцов — типичный пример того, как живое произношение закрепилось в письменном виде. В основе фамилии лежит прозвище Агалец, которое восходит к слову «оголец». В старых говорах у этого слова было два значения: «мелкая рыбёшка» (буквально «оголец», то есть недоросшая рыба) и «сорванец, бедовый мальчишка». Соответственно, прозвище Агалец могли дать либо неудачливому рыбаку, либо озорнику и проказнику.

Чередование гласных о/а в корне — результат «аканья», то есть произносительной нормы, при которой безударное «о» звучит как «а». Так оголец превратился в агальца. Суффикс -ов в фамилии указывает на принадлежность: Агальцов буквально означает «сын Агальца» или «потомок Агальца».

Форма фамилии с суффиксом -ов (а не, скажем, -ин) говорит о том, что прозвище было мужским и оканчивалось на твёрдый согласный. Это самая распространённая модель русских фамилий, особенно в центральных и южных регионах России, где аканье было повсеместным. Других распространённых версий происхождения у этой фамилии нет — корень прозрачен, и все дополнительные гипотезы были бы натяжкой. Таким образом, Агальцовы — потомки человека, которого в своё время прозвали за характер или за занятие.