Фамилия Аганцев — редкая и неочевидная по корню. Чтобы понять её происхождение, стоит оттолкнуться от суффикса. Модель «-ев» указывает на притяжательное значение: «чей?» — Аганцев, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Аганец. Сама основа «Аган-» — это искажённая или диалектная форма имени Агапий (от греческого «агапе» — любовь) или Агафон (от «агатос» — добрый). В народной речи такие имена часто усекались: Агап → Аган, Агафон → Аганя. Суффикс «-ец» мог добавиться в значении «уроженец» или «носитель признака»: Аганец — человек, связанный с именем Аган.

Версия с тюркским следом тоже имеет право на существование, хотя она менее вероятна. В некоторых тюркских языках «аган» означает «течение», «поток» или «река». Тогда Аганец — прозвище человека, жившего у воды или быстрого в движении. Но для русской фамильной системы типичнее именно крестильное имя в народной обработке.

Географически фамилия Аганцев встречается в основном в центральной России и Поволжье, что косвенно подтверждает версию с православным именем: именно в этих регионах была сильна традиция переделывать календарные имена на местный лад. Встречаются также варианты написания Агонцев и Аганцов — они возникали из-за акающего произношения («а» вместо «о» в безударной позиции) и неустойчивости суффикса.

Социальный контекст прост: фамилия недворянская, скорее крестьянская или мещанская. Предки Аганцевых, скорее всего, были обычными людьми, получившими фамилию по имени отца или деда. Никаких громких исторических сюжетов за ней не числится — и это нормально: большинство русских фамилий именно такие, бытовые.